Biträdande forskare (Forskningsinfrastrukturexpert), Core Facilities

Ref PAR 2024/93

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

Core Facilities är en öppen universitetsgemensam forskningsinfrastruktur för forskning inom Life Science. Vi finns på Sahlgrenska akademin, Göteborgs universitet, och erbjuder tillgång till några av Sveriges mest avancerade tekniker och analysverktyg för forskning inom t.ex. medicin, biomedicin och kliniska studier. Alla våra enheter har stark nationell och internationell profil och vi är del av bland annat SciLifeLab.  Enheterna vid Core Facilities är utrustade med avancerade instrument och specialiserade experter med hög kompetens. Utöver högklassigt forskningsstöd erbjuder vi också teoretisk utbildning och praktiska kurser. Vår infrastruktur är öppen för alla forskare – både vid Göteborgs universitet och vid andra lärosäten och privat industri i Sverige och internationellt.

Center for Cellular Imaging (CCI), som etablerades 2003, är en nationell forskningsinfrastruktur och en av Sveriges ledande akademiska mikroskopifaciliteter. Här erbjuds tillgång till expertis och avancerade mikroskop för hela forskarsamhället, både lokalt, nationellt och internationellt. (https://www.gu.se/en/core-facilities/centre-for-cellular-imaging). CCI tillhör Core Facilities vid Göteborgs universitet och är också del av National Microscopy Infrastructure (https://nmisweden.se/), Science for Life Laboratory (SciLifeLab, scilifelab.se) och Euro-BioImaging-ERIC (https://www.eurobioimaging.eu/). CCI erbjuder avancerade avbildningstekniker för forskare inom hela Life Science-området, och även inom kemi, fysik och materialvetenskap. Instrumentparken inkluderar ett flertal laserskanning (konfokal och multifoton) mikroskop, traditionella ljusmikroskop, superresolutions-mikroskop, instrument för MALDI-avbildningsmasspektrometri, liksom svep- (SEM) och transmissionselektromikroskop (TEM). På faciliteten finns också tillgång till laboratorier med utrustning för provberedning inför elektronmikroskopi (EM); både med avseende på provfixering (där fixeringen kan göras både vid rumstemperatur, under kryoförhållanden och med hjälp av mikrovågor), inbäddning och snittning med hjälp av avancerad ultramikrotomteknologi. Det vetenskapligt kunniga teamet på CCI stöttar forskare i design och planering av experiment, och tillhandahåller fördjupad utbildning i hantering av mikroskop, liksom i specifika avbildningstekniker. Utöver det erbjuds stöd i att bearbeta och analysera insamlad data liksom tillhandahållande av nödvändig infrastruktur för behandling och lagring av stora mängder bilddata. CCI:s team har ett stort kontaktnät inom mikroskopiområdet och ett brett samarbete med partners från både akademin och den privata industrin.

CCI söker nu en motiverad och erfaren forskningsinfrastrukturexpert (biträdande forskare) inom området smart mikroskopi. Det senaste decenniet har det skett betydande framsteg när det gäller att koppla ihop biologisk avbildning med helt automatiserade och datorkontrollerade mikroskop. Detta görs för att skapa ett adaptivt och automatiskt arbetsflöde, oftast benämnt som smart mikroskopi. Ditt ansvar kommer att vara att både skapa och implementera arbetsflöden inom smart mikroskopi för att tillgängliggöra det för CCIs användare.

 

Arbetsuppgifter 

Vi söker en forskningsinfrastrukturexpert med bakgrund i mjukvaruutveckling och med ett intresse för att skapa, implementera och finjustera verktyg för feedback och responsmikroskopi. Anställningen kommer fokusera på automationen av, t.ex. riktad mikroskopi, funktionell mikroskopi och spårning av celler över tid med bredfälts-, konfokal- och light sheet-mikroskop. Dessutom kommer arbetet att omfatta implementering av smart mikroskopi på elektronmikroskop (TEM och SEM). Bildanalysverktygen kommer att inkludera användning av artificiell intelligens och djup maskininlärning. Rollen kommer att innebära implementering av simultan databehandling med realtidsrespons av mikroskopisk avbildning i arbetsflöden, vilket är av stor betydelse vid avbildning av levande celler. En annan central uppgift är att hantera stora datamängder. Som medarbetare kommer du att arbeta med automatiserad förbehandling av bilder innan de överförs till förvaringsservrar.

Du kommer att samarbeta med dina kollegor på CCI med att:
- Utveckla mjukvaruverktyg för smart mikroskopi för att hjälpa användare i deras forskning.
- Utbilda och träna användare att använda arbetsflöden för smart mikroskopi.
- Hjälpa och träna användare i analys av biologisk avbildning.
- Fungera som support kring planering och design för experiment inom smart mikroskopi.
- Fortbilda dig inom smart mikroskopi genom deltagande i kurser, möten och konferenser samt följa relevant litteratur.
- Tillsammans med kollegor planera undervisning och kurser för forskare och studenter på både grundutbildningsnivå, och doktorandnivå.

 

Kvalifikationer 

Vi söker en serviceorienterad lagspelare med en bakgrund i mjukvaruutveckling som gillar utmaningar i biologisk avbildningsanalys och har utmärkt kommunikations- och organiseringsförmåga.

Kvalifikationskrav:

  • Universitetsexamen inom datavetenskap, matematik, fysik eller ingenjörskonst. Doktorsexamen inom ett av områdena är meriterande men inte ett krav.
  • Dokumenterad erfarenhet i mjukvaruutveckling.
  • Erfarenhet av kontrollsystem som GitHub.
  • Erfarenhet av programmering i Python.
  • Utmärkt kommunikationsförmåga i tal och skrift. Flytande engelska är nödvändigt då CCIs användarbas till stor del är internationell.

Bör ha:

  • Dokumenterad erfarenhet i avbildningsanalys.
  • Kunskap i verktyg för bildanalys, särskilt för program med öppen källkod t.ex. ImageJ Macro, Python, Fiji, Napari, scikit-image.

Meriterande:

  • Bakgrund eller erfarenhet i hårdvarukontroll, särskilt mikroskopi relaterat, t.ex: LabView, Micro-Manager, Pycro-Manager, Python-microscopy och ImSwitch, etc.
  • Erfarenhet av skriptning i arbetsflöden med analys av biologisk avbildning.
  • Bevisad arbetserfarenhet av dataanalys, särdragsextraktion, statistik och maskininlärning.
  • Erfarenhet av undervisning och utvecklande av träningsmaterial.
  • Erfarenhet av Java eller C++.
  • Erfarenhet av avancerad programmering i Python.

Du bör vara beredd att utöka din kompetens inom nya metoder för mikroskopi och avbildning och vara redo att arbeta i en interdisciplinär miljö. I denna roll är det nödvändigt att du kan arbeta med flera användare och projekt samtidigt och på kort varsel kunna strukturera om ditt arbeta. Du förväntas arbeta självständigt men också kunna samarbeta med dina kollegor. Vi letar efter en entusiastisk person med en problemlösningsmentalitet som kombinerar tekniskt kunnande med god kommunikationsförmåga och en vilja att hjälpa andra forskare nå framgång.

 

Anställning 

Anställningen är en tillsvidareanställning på heltid (100 %), placerad vid Centre for Cellular Imaging (CCI) inom Core Facilities, Göteborgs universitet. Sex månaders provanställningsperiod kan komma att tillämpas. Anställningsstart snarast möjligt eller enligt överenskommelse.

Anställningsbenämning: Biträdande forskare

 

Tillsättningsförfarande 

Sökande kommer att utvärderas utifrån bifogade dokument, intervjuer och referenser. Särskild vikt läggs vid kunskap och erfarenhet av att utveckla och implementera analysmetoder inom "bioimage".

 

Kontaktuppgifter för anställningen 

Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta enhetschef Julia Fernandez-Rodriguez (e-mail: juliafer@cci.sahlgrenska.gu.se).  


 

Fackliga organisationer 

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande 

 

Ansökan 

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att klicka på knappen "Ansök". Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Ansök genom att skicka in en elektronisk ansökan (kan skickas in på engelska) vilken ska innehålla ett personligt brev, ditt CV, en lista över publikationer, tre aktuella rekommendationsbrev samt en sammanfattning av din erfarenhet inom området avancerad ljusmikroskopi och/eller bildanalys.

 

Ansökan ska vara inkommen senast: 2024-03-04

 

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.