Bioinformatiker inom Multiomics, Core Facilities

Referensnummer PAR 2023/585

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

Core Facilities är en öppen universitetsgemensam forskningsinfrastruktur för forskning inom Life Science. Vi finns på Sahlgrenska akademin och erbjuder tillgång till några av Sveriges mest avancerade tekniker och analysverktyg för forskning inom t.ex. medicin, biomedicin och kliniska studier. Alla våra enheter har stark nationell och internationell profil och vi är del av bland annat SciLifeLab. Enheterna vid Core Facilities är utrustade med avancerade instrument och specialiserade experter med hög kompetens. Utöver högklassig forskningsservice erbjuder vi också teoretisk utbildning och praktiska kurser. Vår infrastruktur är öppen för alla forskare – både vid Göteborgs universitet och vid andra lärosäten samt privat industri i Sverige och internationellt.

Bioinformatics and Data Centre (BDC) arbetar med sekvensering, analys, visualisering och integrering av storskalig hälsodata. Vi tillhandahåller nya high-throughput tekniker så som next-generation sequencing (NGS) för klinisk och preklinisk forskning. Våra experter inom bioinformatik, statistik, analys och dataintegrering har ett nära samarbete med forskare och tar fram data som möjliggör meningsfull och trovärdig forskning i absolut framkant. Enheten har ett nationellt uppdrag och är del av SciLifeLab och Genomic Medicine Sweden (GMS).

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS; https://nbis.se) är en nationell infrastruktur i snabb utveckling som erbjuder stöd, verktyg och utbildning till den svenska forskargemenskapen inom life science. NBIS utgör bioinformatikplattformen vid SciLifeLab (https://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade teknologier och tekniskt kunnande inom molekylär biovetenskap. NBIS är också den svenska noden i den europeiska infrastrukturen för biologisk information ELIXIR.

Vi expanderar vår kapacitet i vårt supportteam för forskning relaterad till cell- och molekylärbiologi. Anställningen finansieras av NBIS men kommer att vara knuten till Bioinformatics and Data Centre (BDC) vid Core Facilities på Göteborgs universitet.

Du kommer att ingå i ett bioinformatikteam i en spännande forskningsmiljö och kommer att ha många möjligheter att ytterligare förbättra och utveckla nya kompetenser för att hålla jämna steg med bioinformatikens utmaningar och framsteg.

 

Arbetsuppgifter 

Som bioinformatiker kommer du främst att arbeta med bioinformatisk analys av omics-data inom ett brett spektrum av studier relaterade till cell- och molekylärbiologi samt andra forskningsområden. Arbetet innebär att stödja svenska forskare inom detta område under en "avgiftsbelagd tjänst"-modell. Projekten kommer att variera i komplexitet och kommer vanligtvis att syfta till att fastställa hur enskilda komponenter i ett biologiskt system samverkar för att producera en specifik fenotyp, i modellsystem såväl som i ett brett utbud av organismer.

Ansvarsområden inkluderar planering, initiering och utförande av bioinformatiska analyser, kommunikation med forskargrupper, att hålla sig informerad om hur området utvecklas samt att skriva och kommunicera resultat och rapporter. NBIS-experter är också regelbundet involverade i avancerad bioinformatikträning för det svenska forskarsamhället. Regelbundna interna möten och intern kompetensutveckling ingår i anställningen. NBIS ger också tid för yrkesmässig utveckling och möjligheten att utbyta kunskap från NBIS-kollegor i andra delar av Sverige.

Anställningen innebär vissa resor till andra universitet eftersom kunskapsutbyte är en stor del av arbetet inom NBIS. Det är av högsta vikt att upprätthålla en spetskompetens inom analys av såväl aktuella som kommande typer av data.

 

Kvalifikationer 

  • Du ska ha en doktorsexamen i bioinformatik, molekylärbiologi, datavetenskap eller motsvarande ämnen som arbetsgivaren upplever som relevanta för anställningen.

 

Nödvändigt för rollen:

  • Minst tre års erfarenhet av att arbeta med avancerad bioinformatik med inriktning mot storskalig omics-data. Det innebär:
    • Hantering av vanliga och specialiserade bioinformatikverktyg samt programvara på en god till avancerad nivå.
    • Programmering i R/Python på en god till avancerad nivå.
    • Goda kunskaper i att designa och implementera bioinformatiska pipelines i en Linux command line environment och på HPC-kluster.
    • Gedigen erfarenhet av hantering och analys av NGS-data med en grundläggande till god förståelse för deras roll i biologiska processer.
    • Erfarenhet av att kommunicera bioinformatiska koncept till andra målgrupper.
    • En god till avancerad förmåga att självständigt identifiera och lösa komplexa problem genom dataanalys.
    • En god till avancerad förmåga att effektivt hantera och prioritera uppgifter.
    • En god förmåga att ta till sig nya teknologier och aktivt uppdatera sig inom fältet.

  • En god förmåga att samarbeta samt ge service till användare.
  • Förmåga att självständigt utföra dataanalys och dra vetenskapliga slutsatser baserade på omics-data på en internationellt konkurrenskraftig nivå.
  • Självständigt kunna driva projekt framåt.
  • Erfarenhet av biostatistik eller maskininlärningsmetoder.
  • Utmärkt förmåga att kommunicera på engelska i både tal och skrift.
  • En vilja att lära sig nya metoder och färdigheter.

 

Meriterande kvalifikationer:

  • Erfarenhet av analys inom antingen en eller flera av följande områden: single cell eller spatial transcriptomics, proteomics, integrerande analys av multi-omics, samt förmågan att utföra och utvärdera sådana analyser på en hög internationell nivå.
  • Erfarenhet av support inom bioinformatik.
  • Postdoktor-erfarenhet.
  • Goda kunskaper inom experimentell design och mjukvaruutveckling.
  • "Reproducerbar forskning" och "FAIR data" är centrala begrepp för oss. Expertis inom utvecklingen av reproducerbar kod genom användning av code sharing platforms, arbetsflödesspråk och container solutions är meriterande.
  • Erfarenhet av (NMR/MS) metabolomikdataanalys är starkt meriterande.

 

Stor vikt läggs vid hur din erfarenhet och dina kompetenser kompletterar och stärker teamet och den vetenskapliga kunskapen inom NBIS.

Stor vikt läggs vid personlig lämplighet, samt god kommunikations- och samarbetsförmåga. Du är självgående och serviceinriktad samt har en positiv och resultatinriktad inställning.

 

Anställning 

Anställningen är en tillsvidareanställning på heltid (100%), placerad vid Bioinformatics and Data Centre, Göteborgs universitet. Sex månaders provanställningsperiod kan komma att tillämpas. Anställningsstart snarast enligt överenskommelse.

Anställningsbenämning: Bioinformatiker

 

Tillsättningsförfarande 

Sökande kommer att utvärderas utifrån bifogade dokument, intervjuer och referenser. Särskild vikt läggs vid kunskap och erfarenhet av att utveckla och implementera bioinformtatiska analyser inom multi-omics.

 

Kontaktuppgifter för anställningen 

För frågor om anställningen är du välkommen att kontakta Marcela Dávila, enhetschef vid Bioinformatics and DataCentre, marcela.davila@gu.se marcela.davila@gu.se eller  Thomas Svensson, enhetschef vid Support, Infrastructure and Training, NBIS, tel +46 (0)73-305 17 30, thomas.svensson@scilifelab.se.

  

Fackliga organisationer 

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande 

 

Ansökan 

För att söka en anställning vid Göteborgs universitet måste du registrera ett konto i vårt rekryteringssystem. Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att klicka på knappen "Ansök". Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Ansök genom att skicka in en elektronisk ansökan (kan skickas in på engelska), vilken ska innehålla:

- ett personligt brev med beskrivning av varför du söker tjänsten (max 1-2 sidor)

- ditt fullständiga CV inklusive lista över publikationer och patent

- tre referenser (namn, telefon, relation)

- kopia av examensbevis 

 

Ansökan ska vara inkommen senast: 2024-05-17 

 

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.