Doktorandtjänst inom bakteriell bioinformatik

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

Institutionen för kemi och molekylärbiologi bedriver högkvalitativ forskning och utbildning inom kemiska vetenskaper och molekylära livsvetenskaper. Vår forskning och utbildning fokuserar på en djup förståelse av kemiska och biologiska processer i celler och i miljön.

Vi tar oss an viktiga samhällsfrågor som till exempel antibiotikaresistens, cancer, hjärnsjukdomar, miljöproblem och klimatförändringar. På så sätt medverkar vi till att uppnå FN:s globala mål för hållbar utveckling inom områdena god hälsa och välbefinnande, hållbar energi för alla, hållbara städer och samhällen samt bekämpa klimatförändringar.

Institutionen är en internationell miljö med tvärvetenskapliga samarbeten inom både forskning och utbildning, och bidrar starkt till Göteborgs universitets topprankning inom life science.

Institutionen ansvarar för forskarutbildning inom ämnesområdet Naturvetenskap med inriktning mot kemi, biofysik, biologi och utbildningsvetenskap. Därtill är institutionen värd för utbildningsprogram i molekylärbiologi, genomik och systembiologi, kemi, organisk kemi och läkemedelskemi samt receptarieutbildningen. Institutionen samverkar med olika samhällsaktörer som skolor, näringsliv och myndigheter. Institutionen för kemi och molekylärbiologi har runt 200 anställda. Vi finns i centrala lokaler i Natrium på Medicinareberget i Göteborg.

Helicobacter pylori är en bakterie som kroniskt koloniserar magsäcken på ungefär halva jordens befolkning och som kan ge upphov till magsår och magsäckscancer. Antibiotikaresistensen hos H. pylori ökar snabbt och mer kunskap behövs kring dess förmåga att ge upphov till sjukdom och hur den interagerar med magsäcksslemhinnan. Kaisa Thorells grupp studerar H. pylori och värd-patogeninteraktion med fokus på bioinformatisk analys av bakteriell omics-data. Vi studerar stora dataset av bland annat helgenomsekvenser av bakterier från olika delar av världen och med olika sjukdomsprofiler och arbetar även med att karakterisera bakteriella isolat och dess interaktion med humanceller genom RNA-sekvensering, proteomik, glykomik och andra storskaliga dataanalyser. Dr Thorell är nyligen rekryterad PI inom det svenska Data Driven Life Science (DDLS)-inititativet och projektet kommer att bedrivas inom ramen för DDLS. 

Universitetsgemensam information om vad det innebär att vara doktorand vid Göteborgs universitet kan du finna på universitetets doktorandsidor. Forskarutbildning på Göteborgs universitet

Arbetsuppgifter   

Arbetsuppgifterna kommer huvudsakligen att involvera karakterisering av en ny typ av Helicobacter pylori som vi nyligen upptäckt i regioner med hög magsäckscancerrisk (Tourrette, …, Thorell, Falush, BioRxiv, 2024). Dessa bakterier kommer att undersökas ur olika aspekter med fokus på bioinformatisk analys av bland annat RNA-sekvensering och proteomikdata och jämförande genomik. Beroende på kandidatens intressen och kompetens kan även experimentell karakterisering av bakterier från den nya typen ingå. Dessutom kommer tillämpning och vidareutveckling av metoder för pangenomanalys i bakterier vara en del av projektet. Det finns också utrymme för att utforma projektet efter kandidatens idéer och önskemål om inriktning.

Tjänsten är finansierad som en del av initiativet inom Data Driven Life Science (DDLS) där man som doktorand bland annat kommer att erbjudas att delta i DDLS’ forskarskola.

Inom ramen för din doktorandanställning kan du ha institutionstjänstgöring i en omfattning av max 20 % av heltid fördelat under hela utbildningstiden. Institutionstjänstgöring omfattar vanligtvis undervisning på grundnivå och avancerad nivå, men även forskning och administration kan ingå.

Arbetsspråket är engelska och god förmåga att kommunicera både muntligt och skriftligt på engelska är ett krav. Vi söker en kandidat som är motiverad, organiserad, nyfiken och intresserad av akademisk forskning. Du ska uppskatta att arbeta i grupp och bidra positivt till utvecklingen av forskarmiljön. 

Utbildning på forskarnivå omfattar fyra års heltidsstudier och leder fram till en doktorsexamen.

Behörighet 

För tillträde till utbildning på forskarnivå krävs både grundläggande och särskild behörighet. Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som:

1. avlagt examen på avancerad nivå;
2. fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. på annat sätt inom eller utom landet förvärvat motsvarande kunskaper.

Särskild behörighet har den som har:

1. avlagt examen på avancerad nivå i relevant* naturvetenskapligt ämne, eller
2. fullgjort kursfordringar om minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå i relevanta* naturvetenskapliga ämnen, eller
3. på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper relevanta för den planerade utbildningen. *Relevant för den planerade utbildningen på forskarnivå

För särskild behörighet krävs också att sökande behärskar engelska i tal och skrift på en godtagbar nivå. Som riktmärke gäller 550 poäng på TOEFL-test (eller 213 poäng på TOEFL-CBT, eller 79 poäng på TOEFL-iBT). 

Bedömningsgrund   

Urval bland sökande som uppfyller krav på grundläggande och särskild behörighet baseras på förmågan att tillgodogöra sig utbildningen på forskarnivå.   

Vi söker dig med en avancerad examen i molekylärbiologi, biomedicin, bioinformatik eller liknande relevant ämnesområde för projektet. Urval bland sökande som uppfyller krav på grundläggande och särskild behörighet baseras på förmågan att tillgodogöra sig utbildningen på forskarnivå. Vid bedömningen fästs särskild vikt vid dokumenterade kvalifikationer avseende:

Då projektet omfattar storskaliga dataanalyser är dokumenterad formell utbildning samt tidigare erfarenhet av bioinformatisk analys, inklusive command line analyser ett krav.

Programmering samt analys och visualisering av storskaliga data, till exempel i R är starkt meriterande samt ett intresse av att arbeta med machine learning och AI.

Tidigare erfarenheter och intresse av mikrobiologi är en fördel.

Förmåga att arbeta självständigt och professionellt i grupp, ta initiativ, och självständigt organisera sitt arbete.

Arbetsspråket är engelska och god förmåga att kommunicera både muntligt och skriftligt på engelska är ett krav. Vi söker en kandidat som är motiverad, organiserad, nyfiken och intresserad av akademisk forskning. Du ska uppskatta att arbeta i grupp och bidra positivt till utvecklingen av forskarmiljön.  

Anställning   

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning, fyra år

Omfattning: 100 %

Placering: Institutionen för Kemi och molekylärbiologi, Göteborg

Tillträde: Snarast enligt överenskommelse

Efter du har blivit antagen till utbildning på forskarnivå kommer du att erhålla en doktorandanställning vid Göteborgs universitet. Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1993:100. Som innehavare får enbart förordnas den som är antagen till utbildning på forskarnivå. Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Den första anställningen som doktorand får gälla högst ett år och får förnyas med högst två år i taget. En doktorand får som längst vara anställd som doktorand under åtta år men den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år.

Universitetet tillämpar lokalt avtal om lönesättning av doktorander.

Kontaktuppgifter för anställningen   

Kaisa Thorell, +46(0)703-212946, kaisa.thorell@gu.se

  

Fackliga organisationer   

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här:   
https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande   

  

Ansökan   

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att klicka på knappen "Ansök". Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Komplett ansökan innehåller i PDF-format:

• Personligt brev
• CV
• Bevis om examen på avancerad nivå eller fullgjorda kurser, se behörighetskrav ovan
• Bevis om slutförd kurs i Engelska 6 eller motsvarande (gymnasiebetyg eller motsvarande)
• Två referenser (namn, mailadress, telefonnummer, relation)

För sökande med utländsk examen
Om examen är från lärosäte utanför Sverige ä du skyldig att informera dig om vad som gäller för just det landet https://www.antagning.se/sv/Hur-du-anmaler-dig-och-haller-koll/magister-och-master/for-dig-med-utlandsk-kandidatexamen/dokument-fran-ditt-utbildningsland/ - där finns även information om hur det särskilda behörighetskravet i engelska kan uppfyllas.

Ange i din ansökan en kontakt (telefonnummer eller e-post) till utfärdande lärosäte som kan verifiera examen. 

Ansökan ska vara inkommen senast:  2024-06-26

 

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.