Postdoktor i bioinformatik och cancergenetik

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 58 000 studenter och 6800 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

På institutionen för biomedicin bedrivs forskning och undervisning inom prekliniska och kliniska medicinska ämnen. Institutionen är indelad i följande fyra avdelningar: infektionssjukdomar, mikrobiologi och immunologi, medicinsk kemi och cellbiologi samt laboratoriemedicin.

För närvarande har institutionen cirka 315 medarbetare och cirka 450 Mkr i omsättning.

Ämne 

Bioinformatik och cancergenetik.

 

Ämnesbeskrivning 

Somatisk mutationsackumulering och klonal evolution är centrala processer i cancerutveckling. Genom storskalig helgenomsekvensering och storskaliga metoder kan dessa processer kartläggas i detalj, vilket ger insikter i tumörinitiering, progression och behandlingsrespons.

Denna tjänst fokuserar på utveckling och tillämpning av bioinformatiska metoder för analys av genomiska cancerdata, inklusive stora publika internationella dataset och patientnära sekvenseringsdata. Projektet omfattar studier av somatiska mutationsprocesser, klonal dynamik, tumörers utvecklingshistoria eller integrativa analyser av genomiska och kliniska data. Analyser av icke-cancerrelaterade sekvenseringsdata kan också komma i fråga.

Arbetet sker i en forskningsmiljö med stark kompetens inom cancergenomik, beräkningsbiologi och translationell forskning.

Arbeten publicerade av gruppen under senare tid inkluderar:
Elliott et al. Mechanistic basis of atypical TERT promoter mutations. Nature Communications. 2024; Elliott et al. Base-resolution UV footprinting by sequencing reveals distinctive damage signatures for DNA-binding proteins. Nature Communications. 2023; Boström et al. Somatic mutation distribution across tumour cohorts provides a signal for positive selection in cancer. Nature Communications. 2022; Elias et al. Independent somatic evolution underlies clustered neuroendocrine tumors in the human small intestine. Nature Communications. 2021; Van den Eynden et al. Lack of detectable neoantigen depletion signals in the untreated cancer genome. Nature Genetics. 2019 Dec;51(12):1741-1748.

 

Arbetsuppgifter 

Den postdoktorala forskaren kommer att tillämpa och utveckla beräkningsmetoder för analys av helgenomsekvensering och andra NGS-baserade data från patienter, samt designa, implementera och underhålla reproducerbara bioinformatikpipelines. Arbetet kan också innefatta statistiska analyser och visualisering för att identifiera och tolka somatiska mutationsmönster och andra genomiska förändringar, samt integration av genomiska data med kliniska och fenotypiska variabler när så är relevant. Forskaren förväntas bidra till manuskriptförfattande och publicering i internationella vetenskapliga tidskrifter, och kan komma att presentera forskningsresultat vid nationella och internationella konferenser.

 

Behörighet 

Behörighet för anställning som lärare regleras i Högskoleförordningen 4 Kap och Göteborgs universitets anställningsordning. 

Behörig att anställas som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen, konstnärlig doktorsexamen eller som har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

I första hand bör den komma i fråga som har avlagt examen högst tre år före ansökningstidens utgång. Även den som avlagt examen tidigare bör komma i fråga i första hand, om det finns särskilda skäl. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag. 

 

 

Bedömningsgrunder 

Goda programmeringskunskaper och erfarenhet av linux/unix är ett krav. Kunskaper i R eller Matlab är också mycket önskvärt. Tidigare erfarenhet av analys av storskalig sekvenseringsdata rekommenderas. Erfarenhet från relevanta biologiska områden är önskvärt, och den sökande förväntas ha publicerat flera referentgranskade vetenskapliga artiklar. Utmärkta kommunikativa färdigheter krävs, inklusive flytande engelska i tal och skrift.

Bedömningsgrunder vid anställning som lärare finns angivna i 4 kap 3 – 4 § högskoleförordningen samt Göteborgs universitets egen anställningsordning.

 

Anställning 

Anställningen är på heltid och tidsbegränsad, två år med möjlighet till ett års förlängning, med placering tills vidare på institutionen för biomedicin. Tillträde sker enligt överenskommelse.

 

Tillsättningsförfarande 

Hjälp för sökande.

 

Kontaktuppgifter för anställningen 

Har du frågor om anställningen är du välkommen att kontakta Erik Larsson Lekholm, Professor, phone: +46 31 786 6942, e-mail: erik.lekholm@gu.se.

 

Fackliga organisationer 

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/jobba-hos-oss/sa-blir-du-en-av-oss#kollektivavtal-och-fackliga-foretradare

 

Ansökan 

Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att klicka på knappen ”Ansök”. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.  

Ansökan ska innehålla:

• Ett personligt brev med motivering till varför du söker tjänsten
• CV som inkluderar vetenskapliga publikationer
• Två referenser med kontaktuppgifter
• Kopia på bevis för doktorsexamen

 

 

Ansökan ska vara inkommen senast: 2026-05-20

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.